La base de données 3D-IRCADb-01 est composée des images scanner 3D TDM de 10 femmes et de 10 hommes présentant dans 75% des cas des tumeurs hépatiques. Les 20 dossiers correspondant à 20 patients différents peuvent être téléchargés individuellement ou globalement.
Le tableau ci-dessous fournit des informations sur l’image, telles que les dimensions du foie (largeur, profondeur, hauteur) ou encore l’emplacement des tumeurs selon la segmentation de Couinaud. Il indique également les difficultés principales que peuvent rencontrer des logiciels de segmentation du foie dues au contact d’organes voisins, à une forme ou une densité atypique du foie, voire à des artéfacts dans l’image.
Ces dossiers sont nommés « 3D-IRCADb-01-numéro » (le numéro variant de 1 à 20).
Chaque dossier « 3D-IRCADb-01-numéro » contient un ensemble de 4 sous-dossiers nommés « PATIENT_DICOM« , « LABELLED_DICOM« , « MASKS_DICOM » et « MESHES_VTK« . Ces dossiers contiennent respectivement l’image anonymée du patient au format DICOM, l’image labellisée correspondant aux différentes zones d’intérêt segmentées au format DICOM, un nouvel ensemble de sous-dossiers correspondant aux noms des différentes zones d’intérêt segmentées contenant l’image au format DICOM de chaque masque, et enfin, l’ensemble des fichiers correspondant aux maillages surfaciques des différentes zones d’intérêt au format VTK.
Chaque dossier « 3D-IRCADb-01-numéro » contient également 3 fichiers nommés « Creative Commons Attribution.pdf« , « Creative Commons Legal Code.pdf« , et « liver_numéro.jpg« . Les deux premiers fichiers correspondent aux termes de la licence CC, alors que le dernier fichier est une imagette représentant la superposition des différents maillages surfaciques.
Afin de limiter la durée des différents téléchargements, tous les dossiers sont compressés sous la forme de fichiers au format ZIP.
Descriptif des 20 cas de la base Ircadb-01:
Aperçu |
N° |
Sex |
Year of birth |
Voxel size
(mm) |
Image size
(pixels) |
Liver size
(cm) |
Liver
Average
density |
Liver
Pathologies |
Segmentation drawbacks |
Download |
 |
1 |
F |
1944 |
0,57
0,57
1,6 |
512
512
129 |
18,3
15,1
14.1 |
111 |
7 tumours in III, IV/V, VII, VIII |
stomach, pancreas, duodenum |
37.61 Mo
 |
 |
2 |
F |
1987 |
0,78
0,78
1,6 |
512
512
172 |
20,1
16,9
15,7 |
84 |
1 tumour in V |
pancreas, duodenum |
40.82 Mo
 |
 |
3 |
M |
1956 |
0,62
0,62
1,25 |
512
512
200 |
16,7
14,9
15,2 |
108 |
1 tumour in IV |
Artefac due to metal |
60.86 Mo
 |
 |
4 |
M |
1942 |
0,74
0,74
2 |
512
512
91 |
16,9
12,0
17,2 |
107 |
7 tumours |
heart |
28.13 Mo
 |
 |
5 |
M |
1957 |
0,78
0,78
1,6 |
512
512
139 |
19,8
18,6
19,1 |
69 |
0 tumour in Liver |
diaphragm, duodenum |
41.62 Mo
 |
 |
6 |
M |
1929 |
0,78
0,78
1,6 |
512
512
135 |
18,8
14,3
20,2 |
105 |
20 tumours in liver |
Heart |
40.24 Mo
 |
 |
7 |
M |
1946 |
0,78
0,78
1,6 |
512
512
151 |
24,9
15,2
16,6 |
115 |
0 tumour in Liver (1 adrenal) |
spleen |
37.08 Mo
 |
 |
8 |
F |
1970 |
0,56
0,56
1,6 |
512
512
124 |
23,5
17,1
12,5 |
159 |
3 tumours in I, II and IV |
|
33.9 Mo
 |
 |
9 |
M |
1949 |
0,87
0,87
2 |
512
512
111 |
20,6
17,0
18,1 |
90 |
1 tumour in V/VIII |
stomach, colon |
32.76 Mo
 |
 |
10 |
F |
1953 |
0,73
0,73
1,6 |
512
512
122 |
18,4
15,5
14,8 |
104 |
8 tumours |
duodenum, pancreas |
34.55 Mo
 |
 |
11 |
M |
1966 |
0,72
0,72
1,6 |
512
512
132 |
19,1
14,4
16,2 |
108 |
0 tumour in Liver |
stomach, pancreas |
36.07 Mo
 |
 |
12 |
F |
1973 |
0,68
0,68
1,0 |
512
512
260 |
19,3
17,7
11,0 |
118 |
1 tumour in VI |
|
65.12 Mo
 |
 |
13 |
M |
1951 |
0,67
0,67
1,6 |
512
512
122 |
20,0
12,9
18,1 |
111 |
20 tumours |
duodenum, heart |
32.64 Mo
 |
 |
14 |
F |
1970 |
0,72
0,72
1,6 |
512
512
113 |
22,4
15,4
13,4 |
109 |
0 tumour in Liver |
spleen, pancreas |
29.76 Mo
 |
 |
15 |
F |
1946 |
0,78
0,78
1,6 |
512
512
125 |
18,8
17,7
14,7 |
104 |
2 tumours in II and VIII |
pancreas |
29.81 Mo
 |
 |
16 |
M |
1950 |
0,70
0,70
1,6 |
512
512
155 |
20,2
17,7
20,2 |
40 |
1 tumour in V |
muscle |
41.25 Mo
 |
 |
17 |
M |
1942 |
0,74
0,74
1,6 |
512
512
119 |
19,8
17,4
18,9 |
99 |
2 tumours in II and VIII |
stomach, heart |
30.79 Mo
 |
 |
18 |
F |
1958 |
0,74
0,74
2,5 |
512
512
74 |
22,5
15,1
18,6 |
49 |
1 tumour in IV/V |
oesophagus, muscles |
21.69 Mo
 |
 |
19 |
F |
1970 |
0,70
0,70
4 |
512
512
124 |
19,5
16,5
14,2 |
135 |
46 tumours |
stomach, duodenum, pancreas |
31.05 Mo
 |
 |
20 |
F |
1949 |
0,81
0,81
2 |
512
512
225 |
20,0
16,6
16,8 |
59 |
0 tumour in Liver |
stomach |
63.28 Mo
 |
Télécharger les 20 cas (769 Mo)